Hidayatullah adalah organisasi massa berbasis kader yang dibangun atas manhaj Sistematika Nuzulnya Wahyu, yaitu pemurnian akidah tauhid (al ‘Alaq ayat 1-5), khiththah hidup bersama al-Qur`an (al-Qalam ayat 1-7), tarbiyah ruhiyyah (al-Muzzammil ayat 1-7), gerakan dakwah (al-Muddatstsir ayat 1-7, dan membangun lingkungan Islami (al-Fatihah ayat 1-7).
Visi Hidayatullah adalah membangun peradaban Islam. Sedangkan misi Hidayatullah adalah mencapai ridha Allah SWT yang diupayakan melalui:
- Melahirkan kader-kader berkualitas
- Membangun komunitas Islami
- Menjalankan kegiatan dakwah, pendidikan, sosial ekonomi, kepemudaan, kewanitaan dan lain-lain secara profesional
- Membangun sinergi dengan segenap komponen umat
- Berperan secara aktif dalam melaksanakan proses pembaharuan (tajdid) di bidang pemikiran Islam
- Mengajak pemerintah dan umat untuk mewujudkan masyarakat yang berperadaban